Proyectos

CANCERLINC-Papeles funcionales y mecanísticos de los ARN largos intergénicos no codificantes en el cáncer 2011-2018

  • Investigador principal: Maite Huarte Martínez

  • Organismo de financiación: Comisión Europea - 7º Programa Marco

  • Dotación financiera: 1.500.000 €

  • Subvencionado por el Programa del Consejo Europeo de Investigación - Starting Grant

 

Las células de los mamíferos codifican miles de moléculas de ARN estructuralmente similares a los genes codificantes de las proteínas –son largas, están sujetas a splicing (empalme), son poliadeniladas, están transcritas por la Pol II de ARN y tienen con promotores y estructuras exónicas conservados–, pero tienen capacidad de codificación. Aunque existen miles, solo unos pocos de estos ARN no codificantes intergénicos (lincRNA) han sido caracterizados y han mostrado unas funciones biológicas potentes de expresión génica mediante diversos mecanismos epigenéticos y no epigenéticos. De manera significativa, sus patrones de expresión sugieren que algunos lincRNAs están implicados en vías celulares críticas en el cáncer, como la vía p53.

He explorado esta asociación, demostrando que p53 induce la expresión de numerosos lincRNAs. Uno de ellos, el llamado lincRNA-p21, es inducido directamente por p53 para tener un papel fundamental en la respuesta de p53, y es necesario para reprimir globalmente los genes que interfieren en la inducción de apoptosis por p53.  Mis resultados, junto con las pruebas que van surgiendo en este campo, sugieren que los lincRNA pueden desempeñar papeles clave en numerosas vías supresoras tumorales y oncogénicas, lo que representa un paradigma desconocido en la transformación celular. No obstante, sus mecanismos de funcionamiento y sus roles biológicos permanecen en gran medida inexplorados. 

El objetivo de este proyecto es descifrar los roles funcionales y biológicos de los lincRNA en el contexto de las vías oncogénicas para comprender mejor los mecanismos celulares de regulación génica a nivel epigenético y no epigenético, y lograr usar el lincRNA para los diagnósticos y los tratamientos. Con el fin de alcanzar estos objetivos, combinaremos técnicas moleculares y de biología de las células con enfoques genómicos funcionales y estudios in vivo. Y lo que es más importante, la elaboración de perfiles de las muestras de pacientes revelará la importancia de nuestros descubrimientos para la enfermedad humana.

En conjunto, el estudio funcional de los lincRNA no solo será crucial para el desarrollo de mejores diagnósticos y terapias, sino que también ayudará a comprender mejor los mecanismos que rigen las redes celulares.

RNATrain-Red europea de formación en materia de ARN no codificante 2013-2018

  • Investigador principal: Maite Huarte Martínez

  • Organismo de financiación: Comisión Europea - 7º Programa Marco

  • Dotación financiera: 237.680 €

  • http://rnatrain.ku.dk/

 

El ARN no codificante (ncRNA) constituye un nuevo campo de investigación en rápido desarrollo. Se trata de un ámbito con un gran potencial para explicar muchos fenómenos biológicos fundamentales y existen muchas posibilidades de desarrollo de herramientas de diagnóstico y terapéuticas derivadas del ncRNA. Por ello, las empresas biotecnológicas y farmacéuticas están estudiando activamente este terreno inexplorado en busca de nuevos objetivos. Por lo tanto, existe una gran necesidad no satisfecha de formación de científicos en materia de biología, metodología y explotación del ncRNA.

Las regiones que contienen el potencial de codificación de las proteínas (exones) solo suponen el 2% del genoma en los humanos. Las nuevas técnicas de secuenciación han demostrado que los genomas de los mamíferos se transcriben de manera dominante y han revelado la existencia de múltiples clases de ncRNAs. Aunque nuestro conocimiento sobre la multitud de transcripciones producidas por el 98% no codificante del genoma sigue siendo muy superficial, se ha constatado que los ncRNAs desempeñan funciones esenciales en la homeostasis y el desarrollo de los organismos, en la proliferación, diferenciación y apoptosis celular, y en una amplia variedad de patologías humanas.

Por lo tanto, es necesario formar a jóvenes científicos en este importante campo de investigación emergente. Además de mejorar nuestra comprensión colectiva de ciertos fenómenos biológicos esenciales, el ncRNA también constituye un vasto y muy inexplorado terreno para el desarrollo de nuevas terapias y diagnósticos.

Por consiguiente, proponemos la creación de una red europea de formación en materia de ARN, la RNATRAIN. Esta red se dedicará a la formación de la próxima generación de investigadores europeos y se centrará en las funciones y la importancia de los ncRNAs en proyectos multidisciplinarios en los que se estudiarán dichos ncRNAs en relación con el desarrollo, la diferenciación y la enfermedad. Para ello, un grupo de nueve laboratorios de investigación europeos de reconocido prestigio y dos empresas procedentes de ocho países formarán, al máximo nivel, a un grupo de investigadores que empiezan, usando para ello tecnología punta con el fin de analizar minuciosamente las funciones y los potenciales de los ncRNAs a través de proyectos multidisciplinarios integrados.

University of Copenhagen The Netherlands Cancer Institute Max-Delbrück-Center for Molecular Medicine

Gothenburg University Institute of Molecular Genetics of the ASCR University of Basel

Universita Degli Studi di Roma la Sapienza University of Regensburg Intana Bioscience GmbH

Bioneer A/S

 


"Investigamos cómo contribuyen los lncRNAs a los mecanismos de regulación de la expresión génica en las células cancerosas", Dra. Maite Huarte, investigadora principal.

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